More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3881 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  100 
 
 		 365 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  62.5 
 
 		 349 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  62.5 
 
 		 349 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  61.92 
 
 		 349 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00310  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.94 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1286  luciferase family oxidoreductase, group 1  60.82 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0281951  normal  0.0214125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  59.88 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2237  luciferase family protein  61.63 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  48.89 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  49.53 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.38 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  46.5 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  45.82 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.59 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  44.59 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  43.96 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  44.27 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  46.03 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  44.65 
 
 		 332 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  44.27 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  43.7 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  44.62 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  45.34 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  43.95 
 
 		 338 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  44.62 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  43.35 
 
 		 331 aa  232  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  44.03 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  44.03 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  42.9 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  44.03 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  41.72 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  41.72 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  39.94 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  41.4 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  43.99 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  44.41 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  41.72 
 
 		 335 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  43.71 
 
 		 332 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  43.98 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  40.19 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  43.98 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  41.69 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  43.67 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  43.67 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  44.83 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  41.69 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  42.36 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  43.79 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  41.99 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  44.51 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  41.08 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  39.87 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  40.82 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  35.8 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  42.68 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  41.38 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  42.41 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  42.01 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  41.19 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  41.21 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.15 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  40.82 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  41.27 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  39.88 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  44.13 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  42.9 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  43.67 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  41.46 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  42.59 
 
 		 331 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  40.85 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  41.27 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  40.85 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  44.2 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.72 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  41.98 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  39.87 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  43.35 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  39.59 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  42.54 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  42.86 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  40.85 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.04 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.52 
 
 		 338 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  41.82 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  40.13 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  40.99 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  39.08 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  41.19 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  43.04 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.07 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  42.72 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  49.39 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  43.04 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  44.25 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  43.53 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  42.59 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  43.99 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  39.68 
 
 		 333 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>