More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00310  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 377 aa  749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  59.94 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1286  luciferase family oxidoreductase, group 1  60.58 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0281951  normal  0.0214125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  60.35 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  60.23 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  59.94 
 
 		 349 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  59.94 
 
 		 349 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2237  luciferase family protein  59.37 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  42.09 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  43.23 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  42.77 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.04 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  43.37 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  42.09 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  43.44 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  49.06 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.47 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  41.96 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  42.07 
 
 		 338 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  42.9 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  42.04 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  40.4 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  42.22 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  41.9 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.22 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  43.35 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  40.46 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  41.9 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  38.29 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  44.16 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  41.4 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  43.4 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  43.85 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  42.54 
 
 		 424 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  43.53 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  43.53 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  43.4 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  43.75 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  43.4 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  42.68 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  42.99 
 
 		 338 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.16 
 
 		 332 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  43.22 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  38.48 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  41.43 
 
 		 337 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  43.08 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  43.08 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  39.09 
 
 		 338 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  43.08 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  42.59 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  42.04 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  41.01 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  40.35 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  41.23 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  42.59 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  42.14 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  45.28 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  41.72 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  41.62 
 
 		 333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  42.15 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  43.57 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  37.36 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  40.44 
 
 		 326 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  43.84 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  41.3 
 
 		 339 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  38.84 
 
 		 333 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  44.13 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  43.92 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  36.83 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  40.89 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  40.94 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  43.81 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  42.06 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  38.19 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.47 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  37.76 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  40.51 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  43.33 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.12 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  42.41 
 
 		 343 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  37.28 
 
 		 335 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  40.25 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  40.13 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  40.32 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  41.32 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  39.5 
 
 		 326 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  42.11 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  37.14 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  36.98 
 
 		 335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  36.98 
 
 		 335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  40.76 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  40.57 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  36.69 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  43.29 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  40.45 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  41.49 
 
 		 343 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  40.45 
 
 		 333 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  41.18 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>