More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1074 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  100 
 
 		 345 aa  706    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  45.61 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  45.32 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  45.32 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  45.45 
 
 		 333 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  45.32 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  45.45 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  44.87 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  44.74 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  44.74 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  44.15 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  45.7 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  44.38 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  45.06 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.28 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  45.51 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  44.93 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  42.82 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  44.57 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.56 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  43.24 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  45.19 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  44.38 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  43.82 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  41.94 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  43.45 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  41.94 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  43.49 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  43.86 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  43.53 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  45.03 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  41.12 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  41.64 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  41.54 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  43.49 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  41.74 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  42.01 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.35 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  40.91 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  41.18 
 
 		 351 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  42.24 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  42.9 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.14 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  37.5 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.36 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  42.09 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  41.89 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  38.6 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  40.12 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  41.4 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  41.84 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  37.5 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.26 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3497  luciferase family oxidoreductase, group 1  42 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  40.88 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  40.23 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  38.3 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  39.53 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  37.72 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  39.24 
 
 		 343 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  40.68 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  37.03 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  38.95 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  39.24 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  39.35 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  40.41 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  38.12 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  38.53 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  40.52 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  37.22 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 352 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  36.96 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 424 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  39.71 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.24 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  38.12 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  39.42 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  38.84 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4505  luciferase family protein  38.51 
 
 		 350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  38.84 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  38.84 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  35.82 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  40.23 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  39.77 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  39.18 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.65 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  39.18 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  40 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  39.48 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  39.18 
 
 		 332 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  40.18 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  36.07 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  36.73 
 
 		 334 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  39.02 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  38.48 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  39.94 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>