More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3162 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  95.86 
 
 		 339 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 339 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  85.33 
 
 		 334 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  73 
 
 		 348 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  72.12 
 
 		 339 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  73.33 
 
 		 348 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  71.6 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  71 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  44.71 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  42.82 
 
 		 345 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  40.84 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.63 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  40.24 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  39.64 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  39.94 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  39.34 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  39.34 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  39.64 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  39.34 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  39.34 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.45 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  38.74 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  41.12 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  40.43 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  41.12 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  39.94 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  42.44 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  40.42 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  40.54 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  40.24 
 
 		 340 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  37.01 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  38.74 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  39.16 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  38.6 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  39.39 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  39.14 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  40.18 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.88 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  39.21 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  39.4 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  37.06 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  38.81 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  38.1 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  39.32 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  36.86 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  36.36 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  37.16 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.99 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  37.43 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  37.43 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  37.43 
 
 		 349 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 333 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  38.39 
 
 		 347 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  37.73 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.55 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  35.87 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  36.5 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  37.16 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  37.05 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  38.48 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  38.72 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.43 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  39.82 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  35.65 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.34 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  38.71 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  40.72 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  38.07 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  36.7 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.81 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  35.74 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  37 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  34.77 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.57 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  35.14 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  39.64 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  35.08 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  35.4 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  35.4 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  35.4 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  37.92 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  38.76 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  35.4 
 
 		 335 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  35.4 
 
 		 335 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  36.2 
 
 		 336 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  34.56 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  37.92 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  40.23 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  36 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  38.79 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  38.55 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.31 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  35.09 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  38.34 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  35.22 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  37.61 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>