More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7206 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  69.37 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  56.13 
 
 		 323 aa  359  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  54.71 
 
 		 333 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  54.71 
 
 		 333 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  54.71 
 
 		 333 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  54.71 
 
 		 333 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  54.71 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  54.41 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  53.29 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  52.12 
 
 		 333 aa  345  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  52.12 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  54.79 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  54.95 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  54.95 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  53.75 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  53.07 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  52.76 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  50.61 
 
 		 349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  52.45 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  52.45 
 
 		 353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  51.68 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  52.24 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  51.67 
 
 		 349 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  51.37 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.85 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  50.3 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  49.85 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  55.09 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.24 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  37.58 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  37.58 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  37.58 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  37.88 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  37.27 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  37 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  37.27 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  36.67 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  36.28 
 
 		 337 aa  185  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.67 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  35.52 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  37.54 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.67 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.76 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  34.25 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  34.76 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.69 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  36.75 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  36.28 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  36.42 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  34.23 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  35.54 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  36.07 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  36.17 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  33.14 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  33.63 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  36.55 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  34.64 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4505  luciferase family protein  35.31 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  34.04 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  35.76 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  35.15 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.21 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  34.59 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  33.03 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  32.93 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  33.24 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  33.24 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.56 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  31.02 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.62 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  33.05 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  32.43 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  31.38 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  33.24 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  32.93 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  34.38 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.13 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  31.66 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  34.78 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  35.59 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  29.73 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  30.79 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  34.1 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  32.12 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  32.12 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  32.12 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  32.12 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  30.42 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.3 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>