More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6173 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  91.52 
 
 
389 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  91.52 
 
 
389 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  100 
 
 
386 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  56.63 
 
 
323 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  56.46 
 
 
333 aa  355  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  53.75 
 
 
333 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  53.59 
 
 
333 aa  335  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  51.05 
 
 
330 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  51.35 
 
 
333 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  51.49 
 
 
402 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  51.19 
 
 
375 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  51.35 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  51.35 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  51.35 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  51.35 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  52.6 
 
 
342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  49.25 
 
 
331 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.81 
 
 
326 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  49.4 
 
 
349 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  49.4 
 
 
349 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  47.11 
 
 
326 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  48.8 
 
 
349 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  49.1 
 
 
349 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  46.83 
 
 
329 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  47.32 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  50.6 
 
 
325 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  47.9 
 
 
349 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  47.6 
 
 
349 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  51.48 
 
 
265 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  37.13 
 
 
333 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 
333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  36.55 
 
 
333 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  36.26 
 
 
333 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  38.95 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.71 
 
 
334 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  36.55 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  36.18 
 
 
333 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.03 
 
 
349 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  37.11 
 
 
348 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  37.11 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  37.09 
 
 
344 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  37.64 
 
 
339 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 
341 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  35.96 
 
 
341 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  37.65 
 
 
338 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  37.65 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  34.49 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  36.69 
 
 
339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  40.3 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  36.55 
 
 
350 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  36.39 
 
 
339 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  36.47 
 
 
350 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  43.67 
 
 
365 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  36.42 
 
 
334 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  37.6 
 
 
424 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 
397 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  37.92 
 
 
352 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  37.64 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  37.64 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.76 
 
 
342 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  38.35 
 
 
349 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  38.35 
 
 
349 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  35.47 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  37.76 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  35.47 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  40.4 
 
 
349 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  40.91 
 
 
329 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  35.47 
 
 
340 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  39.18 
 
 
333 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  38.19 
 
 
336 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.15 
 
 
335 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  37.9 
 
 
336 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1286  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.58 
 
 
355 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0281951  normal  0.0214125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2237  luciferase family protein  37.09 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  30.45 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  35.78 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  31.04 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  32.55 
 
 
330 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  35.1 
 
 
351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  33.91 
 
 
347 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  33.93 
 
 
335 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  33.62 
 
 
351 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  33.62 
 
 
351 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  36.81 
 
 
355 aa  145  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
330 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  33.62 
 
 
327 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  35.63 
 
 
336 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  39.85 
 
 
337 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.82 
 
 
341 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
332 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  37.85 
 
 
333 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  35.84 
 
 
335 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  41.15 
 
 
341 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  36.08 
 
 
342 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>