More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4429 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  93.97 
 
 		 349 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  99.43 
 
 		 349 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  99.71 
 
 		 349 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  100 
 
 		 349 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  91.09 
 
 		 349 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  91.09 
 
 		 349 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  85.25 
 
 		 353 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  78.7 
 
 		 333 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  78.7 
 
 		 333 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  78.7 
 
 		 333 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  78.7 
 
 		 333 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  78.7 
 
 		 375 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  78.4 
 
 		 402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  71.87 
 
 		 333 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  80.75 
 
 		 265 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  56 
 
 		 330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  52.76 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  55.79 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  54.55 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  50.76 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  50 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  49.4 
 
 		 386 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  50 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  50 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.63 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  44.88 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  45.4 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  47.13 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  46.67 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  38.44 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  38.14 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  38.25 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  38.14 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  38.25 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  37.84 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  37.84 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  37.84 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  37.95 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  37.65 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.99 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  40.24 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  36.34 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  38.21 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  37.69 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.27 
 
 		 349 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  38.6 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  38.67 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  37.46 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  39.46 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  38.18 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  37.69 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  38.24 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  34.12 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  36.17 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.54 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  36.09 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  38.96 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  38.37 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  36.2 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.1 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  37.42 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.08 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  35.84 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  40.83 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  36.23 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  38.02 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  36.23 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  36.23 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  36.15 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  39.77 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  37.42 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.06 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  46.19 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1544  luciferase family protein  36.28 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.28 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  38.86 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  37.95 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  37.65 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.19 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  44.31 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  36.34 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3497  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.21 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  34.41 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.87 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  31.33 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  36 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  42.15 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  36.12 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  30.65 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  36.15 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  35.24 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>