More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1544 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1544  luciferase family protein  100 
 
 		 385 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  41.46 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  39.1 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  40.84 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  37.05 
 
 		 338 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  38.6 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  37.43 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  36.53 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  40.12 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  39.82 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  35.93 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  35.24 
 
 		 333 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  35.24 
 
 		 333 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  35.24 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  35.24 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  35.63 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  35.63 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  35.63 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  39.58 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  39.33 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  40.36 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  39.64 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.05 
 
 		 334 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  36.89 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  40.12 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  36.06 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.52 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  37.76 
 
 		 331 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  37.39 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  39.82 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  39.7 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  37.17 
 
 		 312 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  41.52 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  36.59 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  38.24 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  39.58 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  36.12 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  37.69 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  36.83 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.45 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  36.89 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  40.48 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  36.17 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.61 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  38.46 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  36.97 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.03 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  40.91 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  36.42 
 
 		 337 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  37.39 
 
 		 333 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  38.55 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  33.72 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0466  putative soluble lytic murein transglycosylase  35.04 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.356874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  33.23 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  34.14 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  38.39 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  35.84 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  40.67 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  39.82 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  35.54 
 
 		 339 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  42.02 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  36.04 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  34.35 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3277  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.35 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.967037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  35.67 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 328 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  37.99 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0138  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.78 
 
 		 329 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.402113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0210  luciferase-like  39.1 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  37.09 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.95 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  35.74 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  35.54 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  38.07 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  35.74 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  34.91 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.6 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  39.16 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.67 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  37.76 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.96 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  35.37 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  38.67 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  38.86 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  34.67 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  34.67 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  38.02 
 
 		 336 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  35.54 
 
 		 333 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  35.74 
 
 		 349 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  37 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  34.24 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>