More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2381 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
355 aa  712    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  81.53 
 
 
355 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  71.8 
 
 
356 aa  478  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  68.68 
 
 
367 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  63.19 
 
 
345 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  59.83 
 
 
352 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  61.52 
 
 
354 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  61.52 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  61.43 
 
 
347 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  53.18 
 
 
345 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  56.47 
 
 
342 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  54.55 
 
 
340 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  50.58 
 
 
344 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  50.73 
 
 
340 aa  345  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  49.71 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  54.33 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  46.38 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  49.58 
 
 
358 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  52.63 
 
 
350 aa  331  9e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
364 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  54.36 
 
 
345 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  54.47 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  52.19 
 
 
345 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  54.47 
 
 
348 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  55.23 
 
 
344 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  51.76 
 
 
367 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  50.29 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  51.58 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  49.71 
 
 
363 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  48.54 
 
 
340 aa  315  9e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.3 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  44.35 
 
 
351 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  48.98 
 
 
343 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  44.06 
 
 
351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  43.77 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  43.77 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  44.06 
 
 
351 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  43.77 
 
 
351 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.52 
 
 
347 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  48.54 
 
 
345 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  48.25 
 
 
343 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  43.48 
 
 
351 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  43.48 
 
 
351 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  43.7 
 
 
351 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  46.44 
 
 
366 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  44.35 
 
 
352 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  46.55 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  43.8 
 
 
353 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  43.8 
 
 
353 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  41.33 
 
 
345 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  36.52 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  35.11 
 
 
378 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.09 
 
 
387 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  35.51 
 
 
388 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.13 
 
 
734 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.86 
 
 
377 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  36.83 
 
 
367 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 
359 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.61 
 
 
366 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.14 
 
 
365 aa  175  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  35.8 
 
 
396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  34.09 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  34.66 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  33.43 
 
 
374 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  33.52 
 
 
365 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 
374 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  33.24 
 
 
380 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.66 
 
 
381 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  34.64 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  32.87 
 
 
382 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  33.81 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.83 
 
 
361 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 
349 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
386 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  32.67 
 
 
367 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  33.93 
 
 
481 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.94 
 
 
384 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 
371 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  33.24 
 
 
377 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.47 
 
 
352 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  32.95 
 
 
374 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  31.82 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  54.48 
 
 
145 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.97 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  33.43 
 
 
376 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.68 
 
 
402 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  31.69 
 
 
341 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  28.91 
 
 
384 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 
362 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.02 
 
 
353 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.98 
 
 
344 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.97 
 
 
344 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  27.73 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  27.73 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.03 
 
 
331 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.18 
 
 
345 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.32 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>