More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1967 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  100 
 
 		 366 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.29 
 
 		 345 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  72.07 
 
 		 358 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  61.34 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  61.4 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  60.93 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  58.86 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  58.72 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  59.24 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  58.06 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.91 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  53.6 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  53.96 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  42.77 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  49.85 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  47.67 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  44.76 
 
 		 352 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  42.15 
 
 		 345 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  46.63 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  45.95 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  48.98 
 
 		 345 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  45.43 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  47.04 
 
 		 355 aa  275  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  46.78 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  44.12 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  44.6 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  43.7 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  43.48 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  43.93 
 
 		 345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  44.54 
 
 		 342 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  40.06 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  45.11 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  44.83 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  43.09 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  44.06 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  43.91 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  42.35 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  35.9 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  35.34 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  35.06 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  35.04 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  34.76 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  34.77 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  34.77 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  34.49 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  37.21 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  35.04 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  34.57 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  34.57 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.43 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.56 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  33.83 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.21 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  34.83 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  36.67 
 
 		 734 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  32.04 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.14 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  32.29 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  29.72 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.96 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  34.65 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.68 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.89 
 
 		 145 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  32.57 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  29.23 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  30.72 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.52 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  30.29 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  31.3 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  30.43 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  30.79 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  28 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.12 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  32.31 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  28.41 
 
 		 388 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  31.21 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.28 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.36 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  28.65 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  33.18 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.21 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 		 364 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  27.17 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  36.67 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  31.82 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  36.76 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.4 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.4 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.4 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>