More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 365 aa  740    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  61.73 
 
 		 734 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  59.22 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  45.56 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  44.09 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  44.9 
 
 		 374 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  43.82 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  40.83 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  37.07 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  37.39 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  36.57 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  37.64 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.18 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  37.29 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  36.86 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.8 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  35.6 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  34.31 
 
 		 378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  35.8 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  38.66 
 
 		 481 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  36.16 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  33.62 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  35.53 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  35.23 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  35.04 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  33.99 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  35.05 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 410 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.62 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  31.58 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.76 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  31.49 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.56 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  30.86 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  34.66 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  35.07 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  29.65 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  34.53 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  29.65 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  36.89 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  35.15 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  29.36 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  31.19 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  31.19 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.77 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  34.47 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  29.65 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  35.65 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  34.11 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  34.58 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  29.88 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  32.21 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  32.02 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  34.27 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  34.32 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  34.21 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  34.71 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.16 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 		 344 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  32.78 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  32.4 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  32.78 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  32.34 
 
 		 353 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  33.53 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  32.79 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  32.54 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  32.01 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  31.34 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  34.72 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  32.04 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  33.53 
 
 		 363 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  31.73 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.39 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.49 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.18 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.97 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.85 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.27 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  29.28 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.88 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.43 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  28.95 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  28.95 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.94 
 
 		 334 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.48 
 
 		 342 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  28.83 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>