More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2854 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 353 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  94.05 
 
 		 354 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  81.1 
 
 		 347 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  75.92 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  60.8 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  63.45 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  63.16 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  63.24 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  61.95 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  56.76 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  54.97 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  55.07 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  51.45 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  52.05 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  49.42 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  53.1 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  52.91 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  54.05 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  54.41 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  54.68 
 
 		 344 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  53.31 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  53.31 
 
 		 348 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  50.44 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  50.43 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  50.88 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  49.43 
 
 		 358 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  50.14 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  48.73 
 
 		 364 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  49.13 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  48.7 
 
 		 345 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  49.13 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  47.66 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.38 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  45.43 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  46.49 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  46.49 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  40.88 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  41.18 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  40.59 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  40.59 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  40.12 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  40 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  40.29 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  40.29 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  39.71 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  44.54 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  39.41 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  39.77 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  42.2 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  42.2 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.04 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  35.93 
 
 		 734 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.95 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  32.46 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.34 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  29.39 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  52.55 
 
 		 145 aa  149  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  28.99 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  30.77 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  29.51 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  29.71 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  29.51 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29.97 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  29.63 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.86 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  28.24 
 
 		 396 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  30.09 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.2 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  28.16 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  28.16 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  26.93 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  27.79 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  27.75 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  27.64 
 
 		 481 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  32.47 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.69 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.96 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.41 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  33.33 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.57 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.59 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.35 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  32.52 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  26.75 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.25 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.65 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>