More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1541 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  100 
 
 		 382 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  75.93 
 
 		 379 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  65.6 
 
 		 387 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  63.54 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  62.3 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  32.37 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.44 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  38.29 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  38.29 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  38.29 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  37.84 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  37.84 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 386 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.03 
 
 		 365 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.03 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.08 
 
 		 402 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.41 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.09 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.09 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.44 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.75 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  26.04 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  27.57 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  27.57 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.84 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.59 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  30.21 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.23 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.8 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.69 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.97 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.1 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.61 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  33.47 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.61 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  33.17 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.87 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.71 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  25.14 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  37.84 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.3 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  36.18 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  47.96 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  47.96 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  34.1 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.66 
 
 		 333 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.81 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.88 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.59 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  23.23 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  29.35 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  32.82 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.75 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.99 
 
 		 327 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  30.36 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  37.59 
 
 		 341 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  31.36 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  28 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  29.9 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25.23 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  39.2 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  31.75 
 
 		 306 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.78 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  31.15 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  42.86 
 
 		 346 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.47 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  25.27 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.92 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  27.88 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  31.77 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  28.16 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  33.58 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  32.82 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.09 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  24.73 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  28.64 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  27.46 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  28.64 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  32.09 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  38.05 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.43 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.05 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.77 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  30.46 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  31.61 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  42.86 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  40.54 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  32 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>