More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4156 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  100 
 
 		 353 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  55.24 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  40.85 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  37.22 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  28.45 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.59 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.09 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.4 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.62 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  24.86 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.59 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.58 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.64 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  28.64 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  20.87 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  28.22 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  22.61 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.21 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.11 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  24.88 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  24.88 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  31.18 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.61 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  24.25 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  24.15 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  23.96 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  23.35 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  30.65 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  24.5 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  24.2 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  24.57 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.15 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  25.44 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  24.72 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  25.47 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  26.96 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.03 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  25.53 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.25 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  29.12 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.93 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  22 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.56 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  27.04 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  27.04 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  27.04 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  38.68 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  24.49 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  23.6 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  22.45 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  31.37 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.47 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  24.32 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  28.02 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  25.1 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  24 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  26.41 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  24 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  23.72 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  26.29 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25.14 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  22.5 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.54 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.81 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  23.71 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  23.29 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  24.27 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.65 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.07 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  31.45 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.37 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  26.16 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.16 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  24.59 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  24.93 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  23.18 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  27.27 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  28.22 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  20.92 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  30.07 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.23 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  25.44 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  26.15 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.11 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  22.32 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.03 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  24.54 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  24.05 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>