More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3549 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
343 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  59.5 
 
 
329 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  57.59 
 
 
327 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  43.54 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  42.04 
 
 
333 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  37.07 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 
329 aa  192  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  39.19 
 
 
353 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
374 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  26.35 
 
 
315 aa  125  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  36.92 
 
 
364 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  36.07 
 
 
362 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.47 
 
 
352 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  30.29 
 
 
341 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.16 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  38.2 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  30.77 
 
 
331 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.37 
 
 
347 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.87 
 
 
346 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  35.37 
 
 
352 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.87 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27.87 
 
 
346 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  33.71 
 
 
342 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.8 
 
 
355 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.2 
 
 
356 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  32.09 
 
 
365 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.7 
 
 
347 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  35.59 
 
 
386 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  32.07 
 
 
334 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.84 
 
 
362 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 
362 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  34.7 
 
 
354 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.17 
 
 
371 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  33.51 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.14 
 
 
323 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  31.53 
 
 
348 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.21 
 
 
345 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.33 
 
 
346 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.57 
 
 
347 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  33.33 
 
 
380 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  33.85 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.21 
 
 
345 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.37 
 
 
347 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
348 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.67 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  32.43 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  31.69 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.76 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  35.12 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  30.96 
 
 
363 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  33.52 
 
 
382 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
379 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  35.54 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  35.78 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  30.24 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 
357 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  38.12 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.41 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.94 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  56.25 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  56.25 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
343 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  36.59 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  56.25 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  55 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  32.32 
 
 
322 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  33.53 
 
 
337 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.74 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  28.47 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  38.22 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  34.8 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  31.82 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  32.14 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  31.55 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  27.93 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.53 
 
 
439 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  31.82 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  31.5 
 
 
415 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  32.29 
 
 
354 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  33.33 
 
 
387 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
366 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 
349 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  27.07 
 
 
365 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  46.15 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  31.52 
 
 
402 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30 
 
 
436 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30 
 
 
436 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  31.92 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30 
 
 
436 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  29.18 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  30.39 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  30.04 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  32.45 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  33.53 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>