More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4004 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  90.79 
 
 		 369 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  100 
 
 		 369 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  56.99 
 
 		 366 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  38.48 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  35.62 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  37.94 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  36.24 
 
 		 366 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  35.65 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  34.07 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  31.78 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  30.94 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  29.84 
 
 		 389 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  32.8 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  31.62 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  30.65 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  30.11 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  30.14 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  30.89 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  30.89 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.43 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.3 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.13 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.78 
 
 		 343 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  33.68 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  27.25 
 
 		 438 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  35.76 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  34.55 
 
 		 380 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  26.2 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  26.2 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.02 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  26.2 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.82 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  34.07 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.37 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.69 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  24.21 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.6 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25.59 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.95 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  33.87 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.44 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.15 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.03 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  29.41 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.05 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.05 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  23.71 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.6 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  28.94 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  34.35 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  34.35 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.64 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.22 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.67 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  23.31 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  26.29 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  34.35 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  25.47 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  26.13 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  27.22 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  25.55 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  28.28 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.65 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  22.84 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  26.2 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  32.6 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  24.07 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.18 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  30.05 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  25.83 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  27.3 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  27.36 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  29.27 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2712  luciferase family protein  25.99 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.688075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1469  luciferase-like  23.04 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  37.86 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  33.88 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  26.18 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  23.02 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  25.81 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.16 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  23.1 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  33.7 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2757  alkanesulfonate monooxygenase  26.2 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0174174 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  25.85 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  31.79 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.92 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  31.79 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>