More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2315 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
343 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  59.17 
 
 
344 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  57.86 
 
 
348 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  59.17 
 
 
344 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  58.6 
 
 
376 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  58.33 
 
 
348 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  58.04 
 
 
346 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  57.57 
 
 
345 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  55.82 
 
 
347 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  58.36 
 
 
341 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.3 
 
 
372 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  51.32 
 
 
405 aa  279  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.49 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.89 
 
 
364 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  30.61 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.86 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  42.74 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  42.74 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  40.76 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.57 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  45.54 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
364 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  38.98 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  25.5 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.09 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.54 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  26.27 
 
 
439 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.18 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25.71 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  26.21 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 
344 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  25.49 
 
 
436 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  46.15 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  25.49 
 
 
436 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  25.49 
 
 
436 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  30.58 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.89 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.06 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  36.07 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  36.07 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  42.06 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  42.48 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.84 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.05 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  29.31 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.87 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  35.25 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.84 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  30.36 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.87 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.23 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  51.19 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.65 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  34.4 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  32.87 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  34.75 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  42.86 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  34.71 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.79 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  36.28 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.35 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.87 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  27.36 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  40.52 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.91 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  28.14 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  34.29 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.88 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  34.43 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  35.29 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.96 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  28.33 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  27.13 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.25 
 
 
6889 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  27.13 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  29.8 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  26.52 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  34.78 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  27.69 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  26.32 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  33.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  39.29 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  27.61 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  34.55 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  30.83 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  29.39 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  31.38 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  36.13 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  25.87 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>