More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2745 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  100 
 
 
405 aa  782    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  69.39 
 
 
372 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  54.79 
 
 
341 aa  318  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  53.41 
 
 
376 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  54.88 
 
 
344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  54.55 
 
 
344 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  51.63 
 
 
345 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  52.28 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  52.57 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  53.03 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  51.66 
 
 
347 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  51.32 
 
 
343 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.26 
 
 
342 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  41.43 
 
 
364 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
341 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 
362 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.36 
 
 
381 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  29.43 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  29.5 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  37.9 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.52 
 
 
354 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  29.39 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  31.86 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  31.12 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  29.36 
 
 
345 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  28.83 
 
 
340 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  38.33 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  28.88 
 
 
340 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  39.2 
 
 
334 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  27.76 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.25 
 
 
341 aa  89.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  39.2 
 
 
334 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  28.14 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
340 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  39.32 
 
 
364 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.78 
 
 
329 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  31.27 
 
 
361 aa  86.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 
341 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.46 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  36.5 
 
 
374 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  38.14 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  36.89 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  36.89 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  36.89 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  36.89 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  36.89 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  28.44 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  41.75 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  27.68 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  49.4 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  24.85 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  28.04 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  28.7 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  36.07 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  28.28 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  37.72 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  36.75 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  27.6 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  26.3 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  36.84 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  25.66 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  27.95 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  30.54 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  25.77 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.23 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  31.36 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.44 
 
 
6889 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  37.19 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  47.92 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  29.76 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  49.4 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  26.43 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25.98 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  42.27 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  39.8 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  31.44 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  31.11 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  31.11 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  42.11 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  34.48 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  34.48 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  31.87 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  33.54 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  37.39 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  30.87 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  37.39 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  37.39 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  27.33 
 
 
343 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  43 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  39.81 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  27.33 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  43 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>