More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0398 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
346 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  77.19 
 
 
372 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  58.81 
 
 
359 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  59.52 
 
 
344 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  57.44 
 
 
341 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  56.21 
 
 
342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  51.53 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  45.97 
 
 
341 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  45.1 
 
 
338 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  41.3 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  42.01 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  42.77 
 
 
337 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  42.42 
 
 
338 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  36.59 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 
338 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 
344 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  32.83 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  32.1 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  30.7 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  29.97 
 
 
340 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  30.17 
 
 
344 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  29.97 
 
 
340 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 
340 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.23 
 
 
361 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  29.41 
 
 
340 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.03 
 
 
340 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.53 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  29.33 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  30 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 
340 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
341 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 
340 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  27.51 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.05 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  28.61 
 
 
361 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  29.23 
 
 
340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  26.3 
 
 
341 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  28.13 
 
 
340 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  28.24 
 
 
340 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  27.71 
 
 
348 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  26.89 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.64 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 
344 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.46 
 
 
344 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.93 
 
 
274 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.24 
 
 
345 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.93 
 
 
372 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.23 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  29.97 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.47 
 
 
347 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  31.06 
 
 
258 aa  87  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.06 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.3 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.33 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.85 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.01 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.11 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  30.45 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.21 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  31.22 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.19 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  30.45 
 
 
734 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.05 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  39.05 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.03 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  38.1 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.23 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  30.89 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.39 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  24.14 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  36.04 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  26.11 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.74 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  40.66 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.1 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  27.59 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.22 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.32 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  37.65 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.49 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  27.59 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  30.52 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.13 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  26.17 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  23.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.04 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  27.71 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  27.71 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  30.97 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>