More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1646 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  100 
 
 		 405 aa  837    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  57.67 
 
 		 389 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  52.58 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  52.59 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  52.84 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  48.73 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  47.8 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  48.46 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  48.46 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  46.52 
 
 		 413 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  31.42 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  30.94 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  30 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  26.68 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.87 
 
 		 353 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  28.69 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.1 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  27.64 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.56 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  27.68 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.6 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.83 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  31.1 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.74 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.14 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.82 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 		 329 aa  96.3  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  25.81 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.96 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  33.33 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.33 
 
 		 439 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  28.62 
 
 		 330 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  24.53 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.19 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  33.9 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  33.9 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  33.9 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  31.88 
 
 		 331 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  31.28 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.33 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.69 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  24.23 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.34 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.27 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  29.3 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.26 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  29.3 
 
 		 345 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  26.91 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.91 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  23.61 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  30.46 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.02 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  23.42 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.97 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  31.54 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.67 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  24.62 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.44 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.1 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  25.07 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  33.86 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  35.29 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  25.6 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  26.75 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  23.65 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0182  luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.58 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  34.64 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  34.64 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.05 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1589  luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  23.54 
 
 		 6889 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.07 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.37 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.95 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  29.59 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  32.74 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  26.79 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  23.23 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  25.16 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  35.25 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  24.24 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.67 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.54 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  25.31 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  37.38 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>