More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4429 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  100 
 
 
388 aa  797    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  91.73 
 
 
387 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  52.84 
 
 
405 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  58.43 
 
 
391 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  52.59 
 
 
396 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  51.16 
 
 
395 aa  362  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  51.81 
 
 
396 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  51.81 
 
 
396 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  45.48 
 
 
389 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  41.75 
 
 
413 aa  312  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  30.5 
 
 
369 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  30.65 
 
 
369 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 
366 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  28.57 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  28.3 
 
 
368 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  31.54 
 
 
362 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  28.24 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
352 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.49 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.36 
 
 
362 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.34 
 
 
341 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.5 
 
 
331 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  25.96 
 
 
360 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.96 
 
 
355 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.33 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.69 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.3 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.16 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  29.2 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  32.31 
 
 
436 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  32.31 
 
 
436 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  32.31 
 
 
436 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.39 
 
 
330 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25 
 
 
380 aa  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  28.2 
 
 
334 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.08 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  31.79 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.89 
 
 
334 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  32.97 
 
 
439 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  29.53 
 
 
338 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.79 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.17 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.82 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  27.49 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27.46 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  25.75 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.9 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  28.64 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.76 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.9 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.58 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.16 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  27.19 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.9 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.4 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.51 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  25.38 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  25.38 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28.48 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  25.34 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.93 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  28.24 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  24.38 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.36 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.18 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  25 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  41.38 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.33 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  29.1 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.97 
 
 
347 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  28.17 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.4 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.29 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  24.93 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  27.63 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.12 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  28.35 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.49 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.56 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.86 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.44 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  34.17 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.26 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.91 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  27.86 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  25.14 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  32.26 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  23.81 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.26 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  24.76 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>