More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1828 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 329 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  59.5 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  55.96 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  41.52 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  41.52 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.67 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  33.8 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  38.65 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  42.35 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  36.87 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  34.54 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.68 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  37 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 		 372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  37.5 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  36.57 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  36.57 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  35.96 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.95 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  28.75 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.67 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  28.75 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  35.68 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  35.68 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.59 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.49 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27.3 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.79 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  33.02 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.87 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.16 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  29.44 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.33 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  27.65 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  33.74 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.98 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  34.09 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  25.68 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  29.55 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  36.05 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  29.23 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.32 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  25.63 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  33.46 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28.71 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.31 
 
 		 361 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  34 
 
 		 415 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  33.59 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.67 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  29.81 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.53 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.27 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  27.67 
 
 		 413 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.14 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.34 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  35.15 
 
 		 439 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.57 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  35.64 
 
 		 436 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  35.64 
 
 		 436 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  35.64 
 
 		 436 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  35.15 
 
 		 439 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.54 
 
 		 380 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 304 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  24.16 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  28.44 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.12 
 
 		 344 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  30.1 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.22 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  30.32 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.16 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  30.26 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  30.55 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  44.55 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  28.78 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.97 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  32.94 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  31.55 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  26.69 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  41.82 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  28.04 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.46 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  32.95 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  25.97 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>