More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6951 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  100 
 
 
322 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  50.85 
 
 
327 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0810  luciferase family protein  36.82 
 
 
308 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36 
 
 
314 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  29.57 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.1 
 
 
299 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6991  luciferase family protein  33.81 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  35.89 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.7 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  38.12 
 
 
281 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.11 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5777  luciferase family protein  34.75 
 
 
326 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
336 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  28.67 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  40.85 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  33.2 
 
 
336 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  29.87 
 
 
293 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  29.87 
 
 
293 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  39.29 
 
 
278 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  34.29 
 
 
306 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  33.82 
 
 
278 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.44 
 
 
293 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 
299 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  36.88 
 
 
346 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  35.52 
 
 
288 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  33.33 
 
 
309 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30.36 
 
 
335 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  38.56 
 
 
283 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  38.56 
 
 
283 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  38.56 
 
 
283 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.94 
 
 
306 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  31.02 
 
 
334 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.87 
 
 
273 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  37.78 
 
 
293 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  33.15 
 
 
341 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  29.28 
 
 
310 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  39.57 
 
 
296 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  28.5 
 
 
293 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  27.19 
 
 
353 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.13 
 
 
292 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.16 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  37.85 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  37.85 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  29.58 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  28.11 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.03 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  40.65 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.64 
 
 
339 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.53 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  30.39 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  34.78 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  32.52 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
293 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  32.04 
 
 
306 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 
330 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  32.04 
 
 
306 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  32.69 
 
 
306 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  37.41 
 
 
291 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  32.04 
 
 
306 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  39.78 
 
 
282 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  32.49 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  38.85 
 
 
284 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.39 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.39 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  28.14 
 
 
337 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  35.59 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  35.93 
 
 
295 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  26.59 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  37.41 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  30.9 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  37.41 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.66 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  37.41 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  34.13 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.35 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  34.87 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.44 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  31.58 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  33.51 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.66 
 
 
289 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3246  luciferase family protein  29.75 
 
 
292 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.05728  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  37.42 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  31.36 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.82 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  30.91 
 
 
286 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.01 
 
 
288 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  39.76 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  31.94 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  27.38 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  34.44 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  36.6 
 
 
282 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  39.29 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.13 
 
 
288 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4899  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.5 
 
 
291 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  normal  0.510583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>