More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4150 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  96.95 
 
 		 295 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  58.08 
 
 		 288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  48.75 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  48.39 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  48.07 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  47.89 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  42.21 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.3 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  37.14 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  40.1 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.04 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.96 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  40.98 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  35.53 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  36.82 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  35.2 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  29.53 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  35.84 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  34.01 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  33.87 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  33.72 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  32.47 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  32.47 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.17 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  42.86 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  32.47 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  32.21 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  38.94 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  32.32 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  36.79 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.33 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  36.15 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  39.46 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  38.83 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  38.83 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.36 
 
 		 346 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  35.68 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  33.82 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  34.62 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  37.64 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  37.56 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  33.33 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  44.87 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.65 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  33.33 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  32.88 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  35.83 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.36 
 
 		 277 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  34.78 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.04 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  29.86 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  45.3 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  29.72 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 754 aa  89.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  32.08 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.36 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  40.58 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  40.58 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  40.58 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  36.67 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  40.99 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.92 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  31.82 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  35.2 
 
 		 753 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  34.65 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  37.24 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.88 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  35.08 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  38.22 
 
 		 328 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.15 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  37.78 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  37.86 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  36.72 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  37.08 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37.08 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  33.94 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  34.64 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  32.67 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.32 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  35.94 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.11 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.99 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  36.48 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  31.15 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.35 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  34.1 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  36.29 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  34.1 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  34.68 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>