More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4624 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  65.57 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  65.25 
 
 
306 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  65.25 
 
 
306 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  65.25 
 
 
306 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  62.62 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  47.06 
 
 
306 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  38.81 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.01 
 
 
309 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  36.81 
 
 
306 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.55 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  28.12 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  28.76 
 
 
278 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  33.75 
 
 
284 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.34 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.66 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  37.91 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  30.26 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  30.26 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  30.26 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  40.11 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  32.02 
 
 
282 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
286 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
290 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  39.67 
 
 
276 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  32.37 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.97 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  28.9 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  28.9 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  36.23 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.33 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  30.74 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.5 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  37.76 
 
 
272 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.06 
 
 
288 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  29.6 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.76 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  30.45 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  35.32 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  26.96 
 
 
341 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
311 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  32.14 
 
 
366 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  32.14 
 
 
366 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  35.12 
 
 
275 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  32.99 
 
 
367 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  32.99 
 
 
367 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  32.99 
 
 
367 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  32.99 
 
 
367 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  30.13 
 
 
378 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 
295 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  33.51 
 
 
364 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  32.47 
 
 
367 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  26.1 
 
 
294 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  31.44 
 
 
367 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  27.16 
 
 
290 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.52 
 
 
294 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
367 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.81 
 
 
305 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  33.33 
 
 
292 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  32 
 
 
324 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  32.47 
 
 
364 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  27.56 
 
 
305 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.88 
 
 
314 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 
278 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  35.5 
 
 
285 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  34.64 
 
 
289 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
299 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  27.18 
 
 
288 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.11 
 
 
337 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  33.02 
 
 
287 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  33.02 
 
 
298 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  34.91 
 
 
285 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  34.91 
 
 
285 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.49 
 
 
288 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.08 
 
 
292 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 
308 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  37.11 
 
 
290 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 
341 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  35.92 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  31.82 
 
 
341 aa  99  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  28.4 
 
 
363 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  35.54 
 
 
286 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  27.98 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.34 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  33.87 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2531  luciferase-like protein  26.67 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  34.57 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  27.94 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  36.24 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  27.63 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  32.04 
 
 
364 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  31.73 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 
339 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  32.04 
 
 
364 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  27.63 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>