More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1798 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  89.72 
 
 		 363 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  86.2 
 
 		 366 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  85.63 
 
 		 366 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  83.52 
 
 		 364 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  100 
 
 		 364 aa  746    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  89.72 
 
 		 363 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  84.49 
 
 		 369 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  83.24 
 
 		 364 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  83.52 
 
 		 364 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  83.38 
 
 		 364 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  81.97 
 
 		 366 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  80.23 
 
 		 367 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  78.02 
 
 		 367 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  79.66 
 
 		 367 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  79.66 
 
 		 367 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  79.94 
 
 		 367 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  79.66 
 
 		 367 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  78.87 
 
 		 378 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  77.81 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  78.87 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  80.12 
 
 		 370 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  79.37 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  80.4 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  78.69 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  76.1 
 
 		 364 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  75.55 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  75.55 
 
 		 364 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  75.27 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  73.09 
 
 		 369 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  64.23 
 
 		 369 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  63.46 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  61.3 
 
 		 389 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  60.78 
 
 		 376 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  60.06 
 
 		 385 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  61.3 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  60.8 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  57.34 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  57.22 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  53.5 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  55.68 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  34.93 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  34.08 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.82 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.19 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  32.43 
 
 		 387 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  32.74 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  34.86 
 
 		 350 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.64 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  29.83 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  32.28 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  32.28 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  32.88 
 
 		 395 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  30.41 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  33.04 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  32.27 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  32.07 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  32.07 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  28.65 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  32.74 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  29.1 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  30.82 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  29.72 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  30.36 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  29.72 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  29.44 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  29.44 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  33.63 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  29.72 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3342  alkanesulfonate monooxygenase  31.83 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3667  Alkanesulfonate monooxygenase  31.34 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  30.84 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  30.3 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  29.17 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  29.33 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  29.17 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3300  putative alkanesulfonate monooxygenase  27.79 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  29.89 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  30.22 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.13 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  30.3 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.59 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  27.65 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  30.36 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  29.1 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  29.95 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  28.3 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  34.01 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  29.59 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  29.64 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  29.14 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  29.95 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  32.54 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>