More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
355 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  68.68 
 
 
364 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  68.68 
 
 
364 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  68.68 
 
 
364 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  68.68 
 
 
371 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  67.53 
 
 
364 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  56.89 
 
 
363 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  55.34 
 
 
363 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  55.34 
 
 
363 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  55.33 
 
 
365 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  57.77 
 
 
361 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  58.36 
 
 
361 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  55.91 
 
 
363 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  54.12 
 
 
364 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  57.18 
 
 
361 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  56.89 
 
 
361 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  54.47 
 
 
358 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  57.18 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  56.89 
 
 
361 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  58.06 
 
 
390 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  52.89 
 
 
360 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 
369 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  52.69 
 
 
368 aa  355  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  54.31 
 
 
359 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  52.07 
 
 
362 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  51.45 
 
 
362 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  52.81 
 
 
384 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  53.78 
 
 
364 aa  342  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  52.92 
 
 
366 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  51.56 
 
 
366 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  53.82 
 
 
365 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  53.82 
 
 
365 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  54.73 
 
 
377 aa  328  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  50.9 
 
 
369 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  53.82 
 
 
365 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  50.56 
 
 
366 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  51.82 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  51.92 
 
 
359 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  47.95 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  67.6 
 
 
259 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  50.29 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  52.92 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  50.85 
 
 
374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  44.38 
 
 
404 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  45.19 
 
 
379 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.2 
 
 
374 aa  275  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.91 
 
 
399 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  42.06 
 
 
367 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  43.64 
 
 
400 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  39.94 
 
 
361 aa  252  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  45.78 
 
 
362 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  44.86 
 
 
399 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  40.73 
 
 
332 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  37.68 
 
 
386 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  38.72 
 
 
381 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  40.48 
 
 
380 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  36.56 
 
 
371 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  37.83 
 
 
382 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  37.28 
 
 
382 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  37.88 
 
 
375 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  37.42 
 
 
391 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  37.57 
 
 
385 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  38.37 
 
 
476 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  37.73 
 
 
395 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  35.82 
 
 
381 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  37.12 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  39.14 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  35.82 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  39.45 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  39.45 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  36.98 
 
 
385 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 
387 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  38.46 
 
 
384 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  36.12 
 
 
387 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  37.84 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 
387 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  36.97 
 
 
396 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  36.28 
 
 
381 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  37.54 
 
 
382 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 
378 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  37.03 
 
 
380 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  37.96 
 
 
377 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  36.28 
 
 
381 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  35.99 
 
 
381 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  38.11 
 
 
393 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  37.01 
 
 
387 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  38.18 
 
 
388 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  38.23 
 
 
380 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  35.82 
 
 
381 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  36.72 
 
 
379 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  37.1 
 
 
382 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  37.54 
 
 
382 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  38.01 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  37.21 
 
 
380 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  37.01 
 
 
392 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.99 
 
 
381 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  35.99 
 
 
381 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  35.99 
 
 
381 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>