More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1546 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
359 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  79.61 
 
 
358 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  71.71 
 
 
363 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  71.71 
 
 
363 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  75.65 
 
 
361 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  73.52 
 
 
369 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  75.07 
 
 
361 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  75.36 
 
 
361 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  75.36 
 
 
361 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  75 
 
 
361 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  71.67 
 
 
365 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  74.78 
 
 
361 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  70.82 
 
 
363 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  75.65 
 
 
390 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  60.89 
 
 
362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  60.34 
 
 
362 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  59.6 
 
 
364 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  62.78 
 
 
365 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  59.66 
 
 
363 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  62.22 
 
 
365 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  62.78 
 
 
365 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  58.71 
 
 
360 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  57.66 
 
 
368 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  60.51 
 
 
364 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  56.83 
 
 
384 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  52.96 
 
 
367 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  54.65 
 
 
364 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  57.46 
 
 
377 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  54.44 
 
 
364 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  54.9 
 
 
364 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  54.44 
 
 
364 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  55.15 
 
 
367 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  54.9 
 
 
371 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  54.31 
 
 
355 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  52.81 
 
 
366 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  49.58 
 
 
369 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  54.9 
 
 
364 aa  361  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  49.59 
 
 
366 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  50.14 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  50.99 
 
 
362 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  51.11 
 
 
359 aa  338  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  52.02 
 
 
374 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.08 
 
 
374 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  45.63 
 
 
379 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.89 
 
 
399 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  46.13 
 
 
399 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  49.17 
 
 
362 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  58.33 
 
 
259 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  39.22 
 
 
367 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  39 
 
 
361 aa  250  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  37.57 
 
 
404 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  42.17 
 
 
332 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  36.62 
 
 
400 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  41.1 
 
 
393 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  40.48 
 
 
378 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  38.02 
 
 
388 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  39.04 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  42.28 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  36.18 
 
 
386 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  41.11 
 
 
360 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.64 
 
 
381 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  36.8 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.64 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  35.14 
 
 
379 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  36.66 
 
 
381 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  36.81 
 
 
395 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  39.71 
 
 
395 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  38.37 
 
 
381 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  37.96 
 
 
382 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  36.86 
 
 
375 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  37.04 
 
 
382 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  38.63 
 
 
377 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  38.46 
 
 
417 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  38.35 
 
 
389 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  38.35 
 
 
389 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  38.21 
 
 
387 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  38.35 
 
 
389 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  39.2 
 
 
364 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  35.89 
 
 
391 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.84 
 
 
385 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  35.84 
 
 
385 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  36.17 
 
 
385 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  37.27 
 
 
374 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  39.88 
 
 
391 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  38.51 
 
 
387 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  37.85 
 
 
384 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  35.58 
 
 
391 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  36.2 
 
 
476 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  37.83 
 
 
387 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  36.11 
 
 
402 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  35.84 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  38.67 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  37.04 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  35.99 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  37.39 
 
 
364 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  38.12 
 
 
380 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  38.57 
 
 
377 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 
389 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  35.19 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>