More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2534 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  90.44 
 
 		 366 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 366 aa  740    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  76.8 
 
 		 369 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  53.97 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  52.99 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  53.97 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  54.17 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  52.63 
 
 		 369 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  53.89 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  53.37 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  53.37 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  53.65 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  51.25 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  53.37 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  53.06 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  53.37 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  53.33 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  49.6 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  54.9 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  51.25 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  52.38 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  51.37 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  53.09 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  52.81 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  53.61 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  52.53 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  49.18 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  49.59 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  49.45 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  49.19 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  52.99 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  50.56 
 
 		 355 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  46.94 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  48.61 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  50.56 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.01 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  47.77 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.88 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  43.18 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  45.58 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  43.6 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  45.79 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  38.9 
 
 		 404 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  34.05 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  53.75 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  37.36 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  40.84 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  38.55 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  38.25 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  38.25 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  38.07 
 
 		 371 aa  209  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  38.71 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  37.57 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  39.16 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  38.94 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  38.07 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  37.46 
 
 		 385 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  38.64 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  38.82 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  39.76 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  39.05 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  38.41 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  38.48 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  37.58 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  39.17 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  39.17 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  38.76 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  40.58 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  42.19 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  36.21 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  38.87 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  36.6 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  37.76 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  38.87 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  38.86 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  35.65 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  38.58 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  38.87 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  35.84 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.92 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  36.39 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  38.58 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  39.05 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  36.39 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  36.5 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  34.37 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  38.28 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  34.38 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  38.3 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  36.58 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  35.69 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  35.21 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  36.17 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>