More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4461 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  88.01 
 
 		 365 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 363 aa  738    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  87.4 
 
 		 363 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 363 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  84.53 
 
 		 361 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  79.51 
 
 		 369 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  84.29 
 
 		 361 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  83.95 
 
 		 361 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  83.67 
 
 		 361 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  83.67 
 
 		 361 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  83.67 
 
 		 361 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  83.95 
 
 		 390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  76.06 
 
 		 358 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  71.71 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  62.12 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  62.91 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  61.77 
 
 		 362 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  62.98 
 
 		 363 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  61.6 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  57.99 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  59.94 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  59.39 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  57.02 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  60.66 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  57.72 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  53.48 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  56.44 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  57.66 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  52.17 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  54.25 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  53.85 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  56.46 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  56.18 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  55.34 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  53.97 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  56.18 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  56.74 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  52.04 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  55.59 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  50.83 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  46.36 
 
 		 399 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.03 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.08 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  44.54 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  48.52 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  44.38 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  40.92 
 
 		 367 aa  279  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  41.46 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  55.47 
 
 		 259 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  38.27 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  37.46 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  36.75 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.94 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  35.74 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  35.74 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  36.39 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  39.44 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.93 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  34.64 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  35.74 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  33.81 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  35.4 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.02 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  37.69 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  39.22 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.42 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  36.04 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  35.76 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  35.89 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  35.17 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  35.4 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  34.66 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  34.02 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.37 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  35.06 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  35.91 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.67 
 
 		 395 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  35.33 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  34.06 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  35.06 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  34.29 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  35.56 
 
 		 396 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  37.15 
 
 		 371 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  36.53 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  37.65 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  37.38 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  37.38 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  37.04 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  35.48 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  35.24 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  34.99 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  33.84 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  33.03 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  34.91 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  33.79 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  36.31 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>