More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3871 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
369 aa  750    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  79.51 
 
 
363 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  79.51 
 
 
363 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  78.75 
 
 
365 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  77.81 
 
 
363 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  78.22 
 
 
361 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  77.94 
 
 
361 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  77.94 
 
 
361 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  75.27 
 
 
358 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  77.94 
 
 
361 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  77.08 
 
 
361 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  77.14 
 
 
361 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  77.05 
 
 
390 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  73.52 
 
 
359 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  64.11 
 
 
364 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  61.88 
 
 
362 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  61.88 
 
 
362 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  64.46 
 
 
365 aa  454  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  61.41 
 
 
365 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  61.14 
 
 
365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  61.92 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  58.11 
 
 
368 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  58.71 
 
 
360 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  59.89 
 
 
364 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  57.69 
 
 
366 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  57.1 
 
 
384 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  53.99 
 
 
367 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  55.52 
 
 
364 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  51.62 
 
 
369 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  54.57 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  52.63 
 
 
366 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  53.44 
 
 
366 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  55.62 
 
 
364 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  55.06 
 
 
364 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  55.06 
 
 
364 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  55.74 
 
 
377 aa  363  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  53.48 
 
 
362 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  54.7 
 
 
355 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  55.34 
 
 
371 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  55.62 
 
 
364 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  51.8 
 
 
359 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.59 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  50.83 
 
 
374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  47.41 
 
 
399 aa  308  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.17 
 
 
374 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  45.1 
 
 
379 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  48.35 
 
 
362 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  39.57 
 
 
367 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 
361 aa  260  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  40.49 
 
 
404 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  56.52 
 
 
259 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  37.9 
 
 
400 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  38.84 
 
 
332 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  41.1 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  35.79 
 
 
381 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  35.79 
 
 
381 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  36.13 
 
 
381 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  33.97 
 
 
381 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  37.01 
 
 
387 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  35.1 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.14 
 
 
386 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  36.03 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  34.59 
 
 
375 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  36.36 
 
 
382 aa  199  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  36.45 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  33.8 
 
 
387 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  34.48 
 
 
391 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  33.8 
 
 
387 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  35.91 
 
 
378 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
386 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  32.78 
 
 
385 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  35.98 
 
 
388 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  31.71 
 
 
385 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  36.39 
 
 
380 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  38.24 
 
 
360 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  35.1 
 
 
379 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
387 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.56 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  31.71 
 
 
385 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  34.55 
 
 
380 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 
377 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  36.89 
 
 
364 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  34.23 
 
 
381 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  31.13 
 
 
385 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  33.64 
 
 
391 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 
389 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 
389 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  34.94 
 
 
380 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 
389 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  35 
 
 
395 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  36.5 
 
 
404 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  34.78 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  34.78 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  34.01 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 
381 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  36.89 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  34.23 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  32.16 
 
 
476 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 
371 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>