More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2768 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
374 aa  743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  70.03 
 
 
359 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  52.79 
 
 
366 aa  345  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  54.73 
 
 
365 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  54.73 
 
 
365 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  51.4 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  55.3 
 
 
364 aa  328  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  55.71 
 
 
365 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  50.83 
 
 
368 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  51.41 
 
 
362 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 
363 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 
363 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  50.56 
 
 
363 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 
364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  49.86 
 
 
363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.28 
 
 
374 aa  319  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  50.72 
 
 
361 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  49.72 
 
 
360 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  50.72 
 
 
361 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  47.56 
 
 
369 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  50.43 
 
 
361 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  50.43 
 
 
361 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  48.46 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 
358 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 
361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  48.02 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  49.86 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  52.02 
 
 
359 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  47.77 
 
 
366 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  50.83 
 
 
369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  49.15 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  50.85 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  49.43 
 
 
367 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 
364 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  49.57 
 
 
364 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  49.57 
 
 
364 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  48.72 
 
 
371 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  49.03 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.06 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  47.46 
 
 
362 aa  282  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  48.88 
 
 
377 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  45.25 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  41.01 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  46.18 
 
 
362 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  39.94 
 
 
361 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  45.21 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  40.33 
 
 
404 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  40.72 
 
 
400 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  41.38 
 
 
332 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  50.81 
 
 
259 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  38.14 
 
 
387 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  41.27 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  38.08 
 
 
371 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  37.89 
 
 
388 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  38.18 
 
 
378 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  37.06 
 
 
381 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  38.08 
 
 
371 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  38.08 
 
 
371 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  35.06 
 
 
386 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  35.98 
 
 
393 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  36.69 
 
 
377 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  35.52 
 
 
387 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  35.38 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  39.38 
 
 
360 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  34.03 
 
 
381 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.93 
 
 
387 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  34.48 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  34.85 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  34.57 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  35.29 
 
 
395 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  34.95 
 
 
382 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  34.05 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  36.88 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1372  Alkanesulfonate monooxygenase  36.59 
 
 
394 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.05 
 
 
381 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  36.23 
 
 
476 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  34.85 
 
 
382 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  35.37 
 
 
389 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  35.37 
 
 
389 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  34.2 
 
 
385 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  35.37 
 
 
389 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  34.1 
 
 
387 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  34.77 
 
 
375 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  35.24 
 
 
382 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  34.38 
 
 
387 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  34.77 
 
 
391 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.72 
 
 
381 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.77 
 
 
391 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  33.73 
 
 
386 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.42 
 
 
381 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
380 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  40.19 
 
 
360 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0393734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.26 
 
 
381 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  35.26 
 
 
381 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  35.26 
 
 
381 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  35.26 
 
 
381 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>