More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3599 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  95.86 
 
 		 362 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 362 aa  735    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  67.13 
 
 		 364 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  61.77 
 
 		 363 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  61.26 
 
 		 365 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  61.77 
 
 		 363 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  61.88 
 
 		 369 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  60.33 
 
 		 363 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  63.32 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  63.97 
 
 		 368 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  63.19 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  62.61 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  62.32 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  62.32 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  61.16 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  58.92 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  61.74 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  60.89 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  59.18 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  60.34 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  59.38 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  59.61 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  60.78 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  55.87 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  58.64 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  56.52 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  57.58 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  57.97 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  53.89 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  53.09 
 
 		 360 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  53.5 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  53.22 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  53.22 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  53.22 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  54.17 
 
 		 366 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  53.89 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  54.06 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  54.67 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  52.23 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  52.07 
 
 		 355 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  52.53 
 
 		 359 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  51.4 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  48.31 
 
 		 379 aa  318  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.73 
 
 		 399 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  47.53 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.68 
 
 		 374 aa  299  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  50.69 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  39.02 
 
 		 367 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  39.55 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  53.28 
 
 		 259 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  38.4 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  39.66 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  37.82 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  41.54 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  41.23 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  38.08 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  40.11 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  39.83 
 
 		 382 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  40.37 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  38.77 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  37.95 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  37.72 
 
 		 381 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  37.92 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  41.49 
 
 		 380 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  38.72 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  38.77 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  38.14 
 
 		 385 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  41.18 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  36.63 
 
 		 385 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  37.46 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  38.92 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  39.32 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  38.37 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  36.63 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  37.43 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  39.55 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  37.54 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  38.34 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  36.97 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  36.07 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  37.63 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  37.87 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  39.38 
 
 		 379 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  37.37 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  37.43 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  37.43 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  35.99 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  37.43 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  37.43 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  37.43 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  40.06 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  37.77 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  38.91 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  36.72 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  36.53 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  36.57 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  36.57 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>