More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3334 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 362 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  56.18 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  54.72 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  52.35 
 
 		 364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  46.3 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  48.75 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  50.69 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  48.52 
 
 		 363 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  48.52 
 
 		 363 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  50.42 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  48.09 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  48.35 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  50 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  49.72 
 
 		 361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  50.97 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  49.58 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  49.16 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  47.67 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  49.16 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  50.56 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  49.17 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  45.58 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  47.78 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  45.03 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  51.25 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  44.44 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  45 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.3 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  46.94 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  49.59 
 
 		 399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  43.6 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  43.96 
 
 		 367 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  44.75 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  48.74 
 
 		 377 aa  271  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 355 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  46.18 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  44.75 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  44.23 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  44.1 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.6 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  44.1 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  40.38 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  43.66 
 
 		 371 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  43.94 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  40.55 
 
 		 404 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  40 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  40.17 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  46.12 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  35.71 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  33.72 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  34.74 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  33.92 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.4 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  36.95 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  33.63 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  33.62 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  34.55 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  34.44 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  34.71 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  36.14 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  34.5 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  35.76 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  33.71 
 
 		 396 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  33.81 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  35.42 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.23 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  32.75 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  35.42 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.23 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  35.12 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  34.5 
 
 		 380 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  34.9 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  33.98 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  34.12 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  33.7 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  33.7 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  33.92 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  34.64 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4522  Alkanesulfonate monooxygenase  35.93 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  35.88 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  32 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>