More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5179 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  100 
 
 		 367 aa  746    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  72.07 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  52.94 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  51.66 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  47.86 
 
 		 384 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.25 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  49.03 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  47.59 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  43.48 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  43.5 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  43.91 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  43.63 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  43.34 
 
 		 361 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  43.34 
 
 		 361 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  43.34 
 
 		 361 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  42.74 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  40.92 
 
 		 363 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  40.92 
 
 		 363 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  42.66 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  39.57 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  43.91 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  41.99 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  39.14 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  42.25 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  39.95 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  39.02 
 
 		 362 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  41.14 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  42.06 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  39.33 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  39.3 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.01 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  41.35 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  40.27 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  41.01 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  40.5 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  40.22 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  43.32 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  39.22 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  36.99 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  41.41 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  40.64 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  34.4 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  34.05 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  38.94 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  38.64 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  38.64 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  37.81 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  39.23 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  37.82 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  36.39 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  35.87 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  33.81 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  35.26 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  32.75 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  32.46 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  34.95 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  31.98 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  33.64 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  34.95 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  34.14 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  32.94 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  32.64 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  34.04 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  34.04 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  31.88 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  32.55 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  32.42 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  30.77 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  30.06 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  33.04 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  30.56 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  37.11 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  31.14 
 
 		 381 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  31.58 
 
 		 404 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  34.35 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  30.84 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  31.63 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  34.95 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  33.74 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  31.36 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  33.13 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  30.56 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>