More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3933 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  99.18 
 
 		 364 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  96.15 
 
 		 364 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 364 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 364 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  97.2 
 
 		 371 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  68.68 
 
 		 355 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  93.82 
 
 		 259 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  56.27 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  58.15 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  59.43 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  59.48 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  56.18 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  53.22 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  59.2 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  58.91 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  59.2 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  58.91 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  56.18 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  56.61 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  54.85 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  52.66 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  59.2 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  55.06 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  54.62 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  51.8 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  50.68 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  54.14 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  50.84 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  51.67 
 
 		 360 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  53.56 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  54.42 
 
 		 365 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  53.26 
 
 		 365 aa  341  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  52.65 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  50.98 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  54.32 
 
 		 377 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  47.84 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  50.56 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  51.31 
 
 		 359 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  52.98 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  53.47 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  49.57 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  47.08 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.92 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  44.63 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.28 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  43.9 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  42.62 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  43.82 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  38.64 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  36.03 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  38.55 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  42.28 
 
 		 380 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  37.79 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  37.79 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  37.57 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  38.67 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  36.58 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  38.89 
 
 		 395 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  38.58 
 
 		 391 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  36.95 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  39.46 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  38.3 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  36.87 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  39.46 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  38.86 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  38.27 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  40.31 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  40.34 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  36.47 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  40.36 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  38.78 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  39.07 
 
 		 371 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  39.07 
 
 		 371 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  36.45 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  36.28 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  38.11 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  36.86 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  39.2 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  37.76 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  38.89 
 
 		 384 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  35.73 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  36.69 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  35.45 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  37.96 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  38.01 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  36.69 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  38.62 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  38.19 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  37.5 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  37.17 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>