More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4896 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 365 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  87.4 
 
 		 365 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  87.4 
 
 		 365 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  85.21 
 
 		 364 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  64.46 
 
 		 369 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  64.54 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  62.94 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  61.73 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  61.6 
 
 		 363 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  61.6 
 
 		 363 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  61.86 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  59.94 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  60.78 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  64.53 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  64.24 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  64.24 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  62.93 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  63.95 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  63.37 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  59.66 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  62.78 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  62.89 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  58.36 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  56.5 
 
 		 366 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  57.58 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  53.61 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  54.9 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  54.24 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  54.8 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  55.53 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  60.17 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  52.82 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  52.5 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  56.6 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  54.42 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  54.42 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  50.14 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  55.43 
 
 		 374 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  53.82 
 
 		 355 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  54.42 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  54.13 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  47.59 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.39 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.9 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  47.79 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  42.22 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  40.64 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  60.08 
 
 		 259 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  40.88 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  42.21 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  37.29 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  36.73 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  39.81 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  37.95 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  41.41 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  36.73 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  38.2 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  37.46 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  36.09 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  37.88 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  35.54 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  35.69 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.38 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  37.69 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  38.04 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  37.73 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  37.46 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  35.65 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  35.65 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  35.1 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  37.42 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  35.6 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  37.12 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  35.17 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  35.6 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  35.95 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  36.47 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  36.04 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  36.09 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  35.29 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.65 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  36.59 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  34.94 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  37.19 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  36.25 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  37.42 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  35 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  36.25 
 
 		 385 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  36.25 
 
 		 385 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  35.98 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  36.62 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.34 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  36.73 
 
 		 387 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  36 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>