More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3757 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
400 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  79.74 
 
 
404 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  54.65 
 
 
361 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  51.66 
 
 
367 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  48.22 
 
 
384 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.71 
 
 
399 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  45.88 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  48.21 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  46.05 
 
 
379 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  44.29 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  41.46 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  41.46 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.64 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  41.48 
 
 
361 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  40.62 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  41.81 
 
 
361 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  40.86 
 
 
361 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  40.86 
 
 
361 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  40.86 
 
 
361 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  41.6 
 
 
390 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  41.06 
 
 
360 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  40.57 
 
 
361 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  37.9 
 
 
369 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  40.5 
 
 
368 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  39.62 
 
 
363 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  40.11 
 
 
364 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  38.27 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  38.54 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  37.02 
 
 
369 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  39.7 
 
 
363 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  38.1 
 
 
362 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  40.88 
 
 
365 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  40.61 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  41.23 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  37.82 
 
 
362 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  39.34 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  37.36 
 
 
366 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  39.11 
 
 
364 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  41.5 
 
 
362 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  40.72 
 
 
374 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  39.06 
 
 
365 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  41.78 
 
 
377 aa  235  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  36.91 
 
 
358 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  38.55 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  38.55 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  39 
 
 
371 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
364 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  36.62 
 
 
359 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.91 
 
 
374 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  37.95 
 
 
367 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  39.73 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  42.97 
 
 
259 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 
360 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.33 
 
 
381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  32.44 
 
 
382 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  32.84 
 
 
396 aa  155  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  31.69 
 
 
378 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  31.4 
 
 
364 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  30.81 
 
 
332 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  31.85 
 
 
380 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3345  alkanesulfonate monooxygenase  31.14 
 
 
382 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  32.22 
 
 
391 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  31.03 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  31.16 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  31.61 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.29 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 
387 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  31.59 
 
 
387 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.29 
 
 
381 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  32.72 
 
 
371 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  31.7 
 
 
395 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  30.62 
 
 
389 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  32.43 
 
 
393 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  32.24 
 
 
380 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  32.41 
 
 
371 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  32.41 
 
 
371 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  30.86 
 
 
381 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  31.61 
 
 
374 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  30.46 
 
 
380 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  31.02 
 
 
381 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.24 
 
 
380 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 
381 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  32.63 
 
 
391 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 
381 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 
391 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  32.14 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  32.14 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  32.14 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  32.14 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  32.14 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  30.34 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  30.92 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  32.04 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  30.95 
 
 
405 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  30.29 
 
 
379 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 
387 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  29.43 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  30.31 
 
 
375 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  30.32 
 
 
371 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>