More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 399 aa  800    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  65.71 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  60.06 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  55.62 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  47.25 
 
 		 367 aa  348  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  48.76 
 
 		 364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  46.54 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  47.38 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  48.63 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  47.38 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  46.41 
 
 		 404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  46.59 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  47.37 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  46.03 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  46.03 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  46.01 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  45.3 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  45.92 
 
 		 361 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  46.05 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  45.3 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  45.48 
 
 		 361 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  43.78 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  45.18 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  45.73 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  45.48 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  45.2 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  45.2 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  45.48 
 
 		 390 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  46.01 
 
 		 359 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  44.94 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  44.24 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  45.71 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  48.07 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  42.74 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  45.96 
 
 		 365 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  43.32 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  46.39 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  45.13 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  48.06 
 
 		 374 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  43.89 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  44.66 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.91 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  42.98 
 
 		 367 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  44.2 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  43.92 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  43.92 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  43.64 
 
 		 377 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  43.92 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  44.2 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  46.3 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.38 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  47.86 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  35.65 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  36.41 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  35.93 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  32.03 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  33.73 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  34.33 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  31.51 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  33.23 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  33.23 
 
 		 395 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  32.04 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  32.36 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  32.93 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  33.23 
 
 		 379 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  32.94 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  32.27 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  34.91 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  34.48 
 
 		 360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  30.99 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  32.05 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  31.91 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  31.51 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.54 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  31.98 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  32.54 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  32.54 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  31.21 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  31.86 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  32.42 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  32.23 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  31.87 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  32.33 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  32.23 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  32.23 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1579  Alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0431  Luciferase-like monooxygenase  35.52 
 
 		 352 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  31.44 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  31.32 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  30.84 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>