More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3219 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  100 
 
 		 366 aa  743    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  90.44 
 
 		 366 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  76.52 
 
 		 369 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  56.63 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  54.25 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  54.26 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  56.5 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  54.25 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  53.98 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  52.08 
 
 		 364 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  52.72 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  53.8 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  54.17 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  53.44 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  53.41 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  53.11 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  53.41 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  53.41 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  50.83 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  52.72 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  52.08 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  54.24 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  54.24 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  53.98 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  53.06 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  54.8 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  50.69 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 		 358 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  51.97 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  51.56 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  49.3 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  48.91 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  51.61 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.8 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  48.46 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  50.55 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  50.28 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  50.28 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  49.44 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.78 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  50.56 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  43.73 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  44.02 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  45.03 
 
 		 362 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  46 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  39.67 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  38.27 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  34.4 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  41.91 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  51.38 
 
 		 259 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  39.46 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  38.67 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  36.86 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  39.16 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  39.52 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  38.79 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  38.37 
 
 		 391 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  38.37 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  39.58 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  40.36 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  40.36 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  39.07 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  40.06 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  38.48 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  40.06 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  40.79 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  38.99 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  39.76 
 
 		 370 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 		 375 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  40.06 
 
 		 370 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  40.06 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  38.78 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  39.76 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  36.58 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  39.76 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  36.71 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  36.2 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  39.23 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  37.46 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  38.86 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  36.89 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  39.64 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  36.18 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  36.55 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  36.18 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  37.16 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  41.51 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  37.94 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.92 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  35.51 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  36.26 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  35.8 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.3 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  36.02 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>