More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5022 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  89.9 
 
 
387 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
405 aa  809    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  87.47 
 
 
395 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  88.1 
 
 
391 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  88.36 
 
 
391 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  86.16 
 
 
391 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  68.59 
 
 
396 aa  531  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  68.27 
 
 
392 aa  524  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  66.93 
 
 
391 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  67.47 
 
 
381 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  66.67 
 
 
391 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  65.96 
 
 
379 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  67.81 
 
 
402 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  65.96 
 
 
381 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  68.87 
 
 
394 aa  507  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  67.73 
 
 
395 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  64.27 
 
 
382 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  66.49 
 
 
387 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  66.76 
 
 
379 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  64.8 
 
 
382 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  64.4 
 
 
385 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  64.4 
 
 
387 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  64 
 
 
382 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  64.4 
 
 
387 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  64 
 
 
382 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  63.73 
 
 
380 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  65.69 
 
 
381 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  63.44 
 
 
381 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  62.92 
 
 
386 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  63.2 
 
 
382 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  65.43 
 
 
381 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  63.2 
 
 
380 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  62.23 
 
 
375 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  62.93 
 
 
382 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  61.87 
 
 
381 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  62.67 
 
 
382 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  62.5 
 
 
385 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  62.13 
 
 
382 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  62.76 
 
 
385 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  63.2 
 
 
382 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  60.92 
 
 
371 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  61.33 
 
 
381 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  61.6 
 
 
381 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  63.2 
 
 
382 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  64.32 
 
 
391 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  63.54 
 
 
476 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  61.07 
 
 
381 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  60.8 
 
 
381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  60.8 
 
 
381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  65.17 
 
 
382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  62.24 
 
 
389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  61.46 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  60.8 
 
 
381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  60.8 
 
 
381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  60.8 
 
 
381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  62.5 
 
 
386 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  63.28 
 
 
385 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  63.09 
 
 
385 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  63.09 
 
 
387 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  62.83 
 
 
387 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  62.83 
 
 
385 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  62.76 
 
 
382 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  62.76 
 
 
382 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  60.72 
 
 
399 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  62.83 
 
 
385 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  63.45 
 
 
386 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  59.84 
 
 
380 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  64.05 
 
 
384 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  62.3 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1239  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0779  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0825732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1836  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1725  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1989  alkanesulfonate monooxygenase  62.24 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1821  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  62.97 
 
 
382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0382  alkanesulfonate monooxygenase  62.57 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  59.3 
 
 
370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  59.57 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  59.57 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  60.11 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  59.3 
 
 
370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  59.3 
 
 
370 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  59.3 
 
 
370 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  59.3 
 
 
370 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  59.03 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  61.67 
 
 
404 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  61.38 
 
 
377 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  61.13 
 
 
384 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  60.23 
 
 
387 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  61.25 
 
 
395 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2070  Alkanesulfonate monooxygenase  59.44 
 
 
391 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  59.54 
 
 
380 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  59.26 
 
 
395 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5472  sulfonate monooxygenase  59.31 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  58.4 
 
 
388 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  53.02 
 
 
387 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  52.49 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  53.33 
 
 
389 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>