More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4153 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  95.13 
 
 		 361 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  96.25 
 
 		 361 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 361 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  96.83 
 
 		 361 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  99.17 
 
 		 390 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  96.83 
 
 		 361 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  97.12 
 
 		 361 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  83.47 
 
 		 363 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  83.47 
 
 		 363 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  82.45 
 
 		 363 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  81.34 
 
 		 365 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  76.86 
 
 		 369 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  73.68 
 
 		 358 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  74.15 
 
 		 359 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  63.54 
 
 		 364 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  63.36 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  60.72 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  60.17 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  57.88 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  61.94 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  61.39 
 
 		 365 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  56.27 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  61.94 
 
 		 365 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  59.18 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  61.84 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  57.42 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  52.73 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  59.27 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  53.99 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  58.71 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  55.96 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  58.71 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  53.13 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  59.27 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  57.8 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  58.71 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  57.22 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  54.55 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  50.98 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  48.51 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  50 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.98 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.15 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  47.06 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  43.05 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  49.04 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  43.44 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  59.36 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  41.87 
 
 		 400 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  41.81 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  38.55 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  41.59 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  36.47 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  36.81 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  36.83 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  36.07 
 
 		 385 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  36.52 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  36.75 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  36.07 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  39.39 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  36.45 
 
 		 382 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.28 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.28 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  33.53 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  36.15 
 
 		 476 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  36.36 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  35.76 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  40.87 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  33.92 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  37.5 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  39.32 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  38.65 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  36.84 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  37.61 
 
 		 393 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  35.71 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  35.28 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  35.71 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  35.71 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  34.88 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  35.82 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  35.82 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.67 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  38.11 
 
 		 364 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  36.58 
 
 		 386 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  35.82 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  33.85 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  37.8 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  36.25 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  36.25 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  35.34 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  34.43 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>