More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4312 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 404 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  79.74 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  54.34 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  52.94 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  48.27 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.41 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  48.49 
 
 		 366 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  47.38 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  44.38 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  44.79 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  44.38 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  44.17 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  44.04 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 355 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  43.58 
 
 		 361 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  43.42 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  43.42 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  43.14 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  43.14 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  42.86 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  41.42 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  42.31 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  41.14 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  40.49 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  43.42 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  39.83 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  39.67 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  40.82 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  39.55 
 
 		 362 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  42.9 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  42.62 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  42.62 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  41.99 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  39.62 
 
 		 359 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  42.66 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  42.22 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  38.9 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  39.55 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  42.34 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  41.94 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  37.13 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  41.5 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  41.37 
 
 		 365 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  41.87 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  41.6 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  38.23 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  37.57 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  40.33 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.18 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  37.77 
 
 		 367 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  40.27 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  42.97 
 
 		 259 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  35.96 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  34.72 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  34.52 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  33.13 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  32.48 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  33.94 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  34.23 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  34.88 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  33.54 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  34 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3345  alkanesulfonate monooxygenase  31.94 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  31.86 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  33.54 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  33.54 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  32.57 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  34.02 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  34.02 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  34.02 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  34.02 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  34.02 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  34.32 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  32.13 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  31.87 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  34.32 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.73 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  32.36 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  31.86 
 
 		 391 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  32.51 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.73 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  32.59 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  31.07 
 
 		 381 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  31.69 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  34.32 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  32.27 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  31.58 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  32.53 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  32.44 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  32.43 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  31.92 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  31.03 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  31.49 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>