More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2692 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
362 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  72.63 
 
 
364 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  62.84 
 
 
364 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  57.85 
 
 
362 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  57.58 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  56.67 
 
 
368 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  53.46 
 
 
365 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  54.27 
 
 
363 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  52.04 
 
 
363 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  52.04 
 
 
363 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  53.48 
 
 
369 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  54.42 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  54.8 
 
 
365 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  54.57 
 
 
361 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  54.29 
 
 
361 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  54.57 
 
 
361 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  54 
 
 
361 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  54 
 
 
361 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  54.86 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  50.14 
 
 
363 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  52.97 
 
 
365 aa  352  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  52.97 
 
 
365 aa  352  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  50.7 
 
 
358 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  49.04 
 
 
369 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  53.26 
 
 
364 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  50.99 
 
 
359 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  49.19 
 
 
366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  51.25 
 
 
367 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  51.77 
 
 
384 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  48.91 
 
 
366 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  48.2 
 
 
360 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  51.82 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  50.84 
 
 
377 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  48.89 
 
 
367 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  52.98 
 
 
364 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  52.98 
 
 
364 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  52.98 
 
 
364 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  50.82 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  48.47 
 
 
359 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  52.66 
 
 
364 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  53.33 
 
 
371 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  47.46 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.66 
 
 
399 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.11 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  44.94 
 
 
379 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  45.6 
 
 
399 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  40.27 
 
 
367 aa  262  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  43.92 
 
 
362 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  42.66 
 
 
404 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  53.46 
 
 
259 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  41.5 
 
 
400 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  36.94 
 
 
361 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  42.94 
 
 
332 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  37.46 
 
 
387 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  36.9 
 
 
393 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.55 
 
 
381 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.41 
 
 
381 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  35.82 
 
 
378 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.55 
 
 
381 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  35.17 
 
 
382 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.97 
 
 
387 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  35.91 
 
 
382 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  34.68 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  36.64 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  36.49 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  36.21 
 
 
382 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  32.66 
 
 
387 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  36.04 
 
 
371 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  36.04 
 
 
371 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  36.75 
 
 
381 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  34.52 
 
 
386 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  34.62 
 
 
389 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  34.62 
 
 
389 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  34.62 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  36.07 
 
 
387 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  33.83 
 
 
389 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 
386 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 
382 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  35.76 
 
 
375 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  35.17 
 
 
391 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 
382 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  36.94 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  36.94 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  32.68 
 
 
385 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  36.98 
 
 
395 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  34.86 
 
 
399 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  34.59 
 
 
374 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  36.04 
 
 
382 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  35.05 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  33.81 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  32.07 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  34.91 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  35.21 
 
 
380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  35.21 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  32.68 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  35.1 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  35.49 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>