More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2509 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 364 aa  733    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  72.63 
 
 		 362 aa  505  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  65.64 
 
 		 364 aa  484  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  59.18 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  58.36 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  57.1 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  58.36 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  56.86 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  55.52 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  52.72 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  54.37 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  57.98 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  57.7 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  57.63 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  56 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  56.29 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  55.71 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  55.71 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  56 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  55.71 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  52.99 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  53.37 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  54.65 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  53.24 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  52.08 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  50 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 355 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  49.18 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  48.48 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  50 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  52.08 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  51.82 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  51.55 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  50.98 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  50.98 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  49.3 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  51.82 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  50.42 
 
 		 371 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  49.15 
 
 		 374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  47.59 
 
 		 399 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.81 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.32 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  44.04 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  42.74 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  45.63 
 
 		 379 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  46.94 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  39.55 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  40.11 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  52.96 
 
 		 259 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  43.37 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  40.42 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  37.09 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  36.26 
 
 		 386 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  36.15 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  37.16 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  35.52 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  36.5 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  37.31 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  37.31 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  35.57 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  37.08 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  37.24 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  36.12 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  35.28 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  35.28 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  35.5 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  37.5 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  35.12 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  36.47 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  36.47 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  36.36 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  35.22 
 
 		 379 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  35.65 
 
 		 375 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  36.67 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  35.17 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  36.78 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  37.05 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  35.57 
 
 		 476 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  37.13 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  35.28 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  35.1 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.62 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  36.75 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  33.82 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  36.31 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  35.99 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  34.86 
 
 		 391 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  37.35 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  34.77 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  36.34 
 
 		 391 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  35.71 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  38.72 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.84 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>