More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4841 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
364 aa  713    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  85.21 
 
 
365 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  81.37 
 
 
365 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  80.82 
 
 
365 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  64.72 
 
 
364 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  64.41 
 
 
368 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  59.89 
 
 
369 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  60.66 
 
 
363 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  60.66 
 
 
363 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  59.1 
 
 
365 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  62.82 
 
 
361 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  63.37 
 
 
361 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  63.37 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  63.08 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  63.08 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  58.07 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  58.64 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  60 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  62.79 
 
 
361 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  58.24 
 
 
358 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  60.51 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  57.63 
 
 
364 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  62.5 
 
 
390 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  57.66 
 
 
367 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  55.14 
 
 
366 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  56.67 
 
 
384 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  60.86 
 
 
377 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  53.61 
 
 
366 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  52.49 
 
 
369 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  53.6 
 
 
363 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  54.8 
 
 
366 aa  362  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  53.26 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  55.3 
 
 
374 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  50.71 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  54.73 
 
 
359 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  49.03 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  52.92 
 
 
355 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  53.76 
 
 
364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  53.47 
 
 
364 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  53.47 
 
 
364 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.07 
 
 
399 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  53.76 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  53.18 
 
 
364 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.41 
 
 
374 aa  298  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  48.5 
 
 
399 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  47.71 
 
 
379 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  51.25 
 
 
362 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  40.06 
 
 
367 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  40.06 
 
 
361 aa  256  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  41.6 
 
 
404 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  41.23 
 
 
400 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  42.86 
 
 
332 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  58.85 
 
 
259 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  38.62 
 
 
378 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 
387 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  39.56 
 
 
388 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  38.34 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  36.8 
 
 
386 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  37.05 
 
 
385 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  36.98 
 
 
385 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  37.08 
 
 
385 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  38.84 
 
 
382 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  37.89 
 
 
404 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  36.39 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  36.59 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  36.21 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  38.04 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  36.28 
 
 
375 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  37.31 
 
 
381 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  36.84 
 
 
395 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  38.7 
 
 
380 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 
377 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  36.53 
 
 
391 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  39.64 
 
 
405 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  39.26 
 
 
384 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  39.09 
 
 
360 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  37.75 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  38.24 
 
 
382 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  37.65 
 
 
385 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  36.22 
 
 
391 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  37.05 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 
371 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 
387 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  36.09 
 
 
476 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  37.42 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 
387 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  37.35 
 
 
385 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  37.35 
 
 
385 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  36.96 
 
 
380 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  36.25 
 
 
381 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 
371 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  37.12 
 
 
380 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  38.32 
 
 
371 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  36.14 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  37.58 
 
 
381 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  36.36 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  36.83 
 
 
417 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.74 
 
 
386 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  37.38 
 
 
367 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  37.11 
 
 
364 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>