More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2669 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
377 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  57.97 
 
 
362 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  57.14 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  57.66 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  57.66 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  59.44 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  59.38 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  56.34 
 
 
365 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  59.2 
 
 
361 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  58.91 
 
 
361 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  59.2 
 
 
361 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  58.91 
 
 
361 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  58.05 
 
 
361 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  55.77 
 
 
364 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  55.74 
 
 
368 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  55.74 
 
 
369 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  57.76 
 
 
390 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  56.06 
 
 
358 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  60.17 
 
 
365 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  60.86 
 
 
364 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  59.6 
 
 
365 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  59.32 
 
 
365 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  57.46 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  53.09 
 
 
363 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  53.91 
 
 
360 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  56.47 
 
 
384 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  54.73 
 
 
355 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  52.99 
 
 
366 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  50.27 
 
 
369 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  51.21 
 
 
366 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  51.61 
 
 
366 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  51.55 
 
 
364 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  54.87 
 
 
364 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  54.32 
 
 
364 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  54.32 
 
 
364 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  52.78 
 
 
367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  54.04 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  50.84 
 
 
362 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  47.51 
 
 
367 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  53.78 
 
 
371 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.2 
 
 
374 aa  296  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  48.88 
 
 
374 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  49.05 
 
 
359 aa  289  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  46.91 
 
 
379 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45 
 
 
399 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  45.84 
 
 
399 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  48.08 
 
 
362 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  41.41 
 
 
367 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  41.87 
 
 
404 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  40.56 
 
 
361 aa  248  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  58 
 
 
259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  41.78 
 
 
400 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  43.22 
 
 
332 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  40.85 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  38.95 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  38.74 
 
 
378 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  39.17 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  37.72 
 
 
381 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  36.25 
 
 
381 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  42.07 
 
 
360 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  35.65 
 
 
371 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  37.57 
 
 
379 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  40.12 
 
 
364 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  37.5 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  36.9 
 
 
382 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  35.13 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  36.13 
 
 
417 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  37.57 
 
 
379 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  37.39 
 
 
382 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  37.36 
 
 
395 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  37.27 
 
 
402 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  37.8 
 
 
371 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 
389 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  34.49 
 
 
389 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  35.49 
 
 
375 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  34.47 
 
 
391 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  34.35 
 
 
389 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.78 
 
 
381 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  37.31 
 
 
380 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  37.8 
 
 
371 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  37.8 
 
 
371 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  36.17 
 
 
396 aa  176  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  39.16 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.47 
 
 
381 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  35.78 
 
 
387 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  35.33 
 
 
381 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  36.23 
 
 
382 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  35.42 
 
 
387 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.36 
 
 
395 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  35.28 
 
 
389 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  39.3 
 
 
360 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  36.55 
 
 
391 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  33.74 
 
 
391 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  36.92 
 
 
405 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.99 
 
 
386 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  36.42 
 
 
380 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  33.44 
 
 
391 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  35.33 
 
 
382 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>