More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2218 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  90.86 
 
 		 365 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  87.4 
 
 		 363 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  100 
 
 		 363 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  87.4 
 
 		 363 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  83.86 
 
 		 361 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  83 
 
 		 361 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  82.52 
 
 		 361 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  83.29 
 
 		 361 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  82.71 
 
 		 361 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  82.71 
 
 		 361 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  77.81 
 
 		 369 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  83.29 
 
 		 390 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  73.83 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  70.82 
 
 		 359 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  63.03 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  60.33 
 
 		 362 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  59.5 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  61.97 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  57.85 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  58.38 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  61.86 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  58.92 
 
 		 365 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  59.21 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  58.71 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  56.95 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  58.15 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  54.62 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  60 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  58.15 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  54.37 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  58.71 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  59.44 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  52.99 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  57.54 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  52.72 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  54.37 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  54.27 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  50.83 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  55.91 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  49.86 
 
 		 374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.38 
 
 		 399 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  49.16 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.7 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  46.87 
 
 		 399 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  45.92 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  47.67 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  39.14 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  41.42 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  57.87 
 
 		 259 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  37.88 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  39.62 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  39.55 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  35.19 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  38.86 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.5 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  34.88 
 
 		 379 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  39.75 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  37.42 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  35.93 
 
 		 382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  35.84 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.2 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  39.41 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  37.31 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  34.85 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  34.91 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  36.56 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  34.91 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  36.67 
 
 		 375 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  34.94 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  35.74 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  34.31 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  34.91 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  35.67 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  34.31 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  37.61 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  35.21 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  35.49 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  33.73 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  34.06 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  35.86 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  36.96 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.06 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  36.56 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  36.67 
 
 		 380 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  35.48 
 
 		 476 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  34.66 
 
 		 396 aa  189  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  36.84 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.06 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  37.01 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  34.93 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  36 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  33.53 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  37.23 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  33.7 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  35.89 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  34.13 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  33.64 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  34.82 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  35.29 
 
 		 395 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>