More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3345 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3345  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 382 aa  775    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2607  alkanesulfonate monooxygenase  52.37 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3988  alkanesulfonate monooxygenase  52.34 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  0.0666689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3531  alkanesulfonate monooxygenase  52.34 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1534  alkanesulfonate monooxygenase  44.83 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185363  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7799  Alkanesulfonate monooxygenase  43.5 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3331  alkanesulfonate monooxygenase  42.59 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  42.22 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  39.84 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  39.42 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  39.73 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  42.55 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  40.05 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  39.57 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  37.6 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  40.21 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  38.07 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  38.54 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  38.28 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  40.54 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  37.5 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  38.75 
 
 		 378 aa  235  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  39.39 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  44.71 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  36.75 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  36.29 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  39.56 
 
 		 395 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  39.5 
 
 		 391 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  37.08 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  37.08 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  37.08 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  37.2 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  36.53 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  41.09 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  36.8 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  39.18 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  36.51 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  39.82 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  35.04 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  40.48 
 
 		 405 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  39.39 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  38.7 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  35.25 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  38.21 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  39.51 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  37.77 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  39.32 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2070  Alkanesulfonate monooxygenase  37.4 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  41.38 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  36.29 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  39.21 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  35.16 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  35.16 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  37.5 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  36.29 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  38.65 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  36.03 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  39.21 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  35.16 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  36.31 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  35.66 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  37.89 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  39.32 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  35.56 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  36.8 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  35.58 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  35.56 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  40.12 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  40.12 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  35.16 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  37.95 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  35.73 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  38.41 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  35.6 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  35.56 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  35.29 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  34.95 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  36.8 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  38.3 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  36.8 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  39.82 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  38.44 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  35.56 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  35.92 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  35.43 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  35.03 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  35.43 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  35.43 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  37.2 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  38.37 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  35.39 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  38.37 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  38.46 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  35.17 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  38.62 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>