More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3988 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2607  alkanesulfonate monooxygenase  96.67 
 
 
390 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3988  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
390 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  0.0666689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3531  alkanesulfonate monooxygenase  99.74 
 
 
390 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3345  alkanesulfonate monooxygenase  52.34 
 
 
382 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7799  Alkanesulfonate monooxygenase  48.68 
 
 
383 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1534  alkanesulfonate monooxygenase  47.98 
 
 
389 aa  335  7e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185363  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  44.24 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  43.58 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  43.85 
 
 
393 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  43.13 
 
 
381 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  41.24 
 
 
371 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  44.03 
 
 
395 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  42.28 
 
 
391 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  42.28 
 
 
391 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  43.09 
 
 
364 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  43.48 
 
 
405 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  45.38 
 
 
360 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3331  alkanesulfonate monooxygenase  42.59 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  41.73 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  43.09 
 
 
380 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  42.64 
 
 
364 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  40.51 
 
 
382 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  43.36 
 
 
387 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  40.46 
 
 
375 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  41.64 
 
 
417 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  42.33 
 
 
389 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  42.39 
 
 
382 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  42.33 
 
 
389 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  42.33 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  40.21 
 
 
381 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  43.43 
 
 
377 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  41.94 
 
 
388 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  40.69 
 
 
382 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  39.01 
 
 
379 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  43.55 
 
 
395 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  41.89 
 
 
391 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  42.12 
 
 
402 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  39.89 
 
 
392 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  39.73 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  39.37 
 
 
379 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  43.98 
 
 
378 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  43.36 
 
 
391 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  41.88 
 
 
381 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  41.88 
 
 
381 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  39.84 
 
 
380 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  40.27 
 
 
380 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  40.16 
 
 
391 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  38.46 
 
 
381 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  39.62 
 
 
370 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  39.62 
 
 
370 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  39.43 
 
 
385 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  39.3 
 
 
382 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  39.52 
 
 
385 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  38.7 
 
 
385 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  39.35 
 
 
370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  39.14 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  39.84 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  39.57 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  39.62 
 
 
370 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  39.62 
 
 
370 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  39.16 
 
 
382 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  39.08 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  38.9 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  42.34 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  38.92 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  39.16 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2918  alkanesulfonate monooxygenase  39.35 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16545e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  44.84 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  41.51 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  39.47 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  39.35 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
381 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  38.06 
 
 
386 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  39.57 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  37.4 
 
 
381 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  39.32 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  40.26 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  39.74 
 
 
476 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  38.5 
 
 
382 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  38.52 
 
 
399 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  40.11 
 
 
382 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  38.13 
 
 
404 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  38.3 
 
 
386 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  40 
 
 
380 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  39.36 
 
 
387 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  38.83 
 
 
387 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  39.89 
 
 
387 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  37.2 
 
 
380 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  39.74 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  38.34 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  39.95 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5472  sulfonate monooxygenase  38.71 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  39.95 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>